>100フォルダ以上の下層
運用形態見直したら？
pathが既知ならポチポチクリックせずにコマンドで開け
100階層あれもこれもってのじゃないのならショートカットやシンボリック・リンクとかジャンクションでまとめるとか
>ファイルだけをまとめていろいろ作業
も曖昧だし