かなり調べましたが、タブをなくすというのはChromeの仕様的に不可能のようです。
（ポップアップウィンドウとして起動すればなくなるけど、それは通常のメインのウィンドウとしては使えない）

他にも、Tabs Outlinerのウィンドウをメインのウィンドウにドックさせることや
最前面などの操作を連動させることも不可能でした。

どうも作者はツリー型タブと同等の仕様よりも今の仕様のほうが理にかなってて
お勧めだと考えているようで、今後の対応も期待できなさそうです。

チラ裏ですいませんが、Firefoxからの乗り換えを考えてる人の参考になれば。