「IDもAPIパスワード」ってのが2chAPI周りのことなら
RとZ(っていうかAPIパッチ)って情報の格納場所が違うから
それでうまくいかないんじゃないかな?

とSync2chを使ってない俺が推測
ただv2c_sync_3_1_2.zipってjsだから頑張れば直せるんじゃないかな