エンコーダを複数起動させてエンコード速度を上げたいのですが，最大でも２つしか動いていないようです．
エンコード設定にある「エンコードの最大スレッド数」というのは，エンコーダ(lame.exeやneroaacenc.exe)の同時起動数というわけではないのでしょうか．