>>410です。
version 755で
- Bug fix: The width of the tree pane is not correctly restored on start
とのことでしたが，やはり保存されません。

>>456さんが教えてくださった
>消極的対策として、Window化状態で端をドラッグして画面一杯にすることで対応してみた。
>すると、面白いことにこの状態から最大化してみると不具合は出なかった。

も試してみましたが， 私の環境では効果はありませんでした。

>>456さんが書かれた
>iniファイル中の"TreePanelWidth=xx"が幅サイズだが、アプリ全体の横サイズに対しての％表記になっており、これがドット単位の位置合わせが効かない原因だろう。

を，作者にメールで送りました。
さて，どうなることやら。