ホイールの件の者です
windowsの問題かnanaterryの問題かわかりませんが、nanaterry編集中に突然、後ろで開いているchromeが最前面に出てくる事があります
これは文字入力中でもimeの変換中でも問答無用で発生します

その直後にホイールの件が再現されました

確証はありませんが、自動保存のタイミングで発生しているのではないかと思います
引き続き検証してみます