SDカードの基本(規格)では、フォーマット=全消去です。
フラッシュメモリーは磁気記録媒体と違い、上書きできないので、
書き込みができるようにするためには消去(ブロックイレース)することが必要です。
このため、フォーマット(書き込みが出来るように準備)のためには全体を消去する必要があるのです。