自分も同じようにシステムバックアップデータから復元かけようとしたら407kbほどの
小さな未割り当て領域が存在してて、osの管理画面ややパーティションマスター上では
確認できないのにtodo backupで復元しようとするときだけ表示されてレイアウトの
相違ということで復元自体が実行できずに困っています。

あれこれいじったり検索かけても対処法が見つけられないので
これは1度フォーマットかけてから再びパーティション切り分けてなんとかなればいいのですが…