自分はLinuxだけど
mpv、mplayer、その他設定の設定用フォルダを別々に作って
smplayer -config-path "設定ファイルのフォルダ"
を記述したスクリプト作って起動してる
Windowsもショートカットにコマンド指定でいけるんじゃないかな