それはソフト本体が常駐してるからそうなるのであって、常駐をやめて毎回起動するようにすればいい
共通設定の全般の左下、[タスクトレイ]の<タスクトレイを使う(T)>って奴の1つ下の、<タスクトレイに常駐(R)>ってやつのチェックを外せばいい

<タスクトレイを使う(T)>かはお好みだけど常駐しない場合は意味無いので外して
ランチャーで起動、タスクバーにピン止めしたアイコンで起動、とかしてる