個別ロスレスが良いんじゃないか
外部cue+1ファイルはHDDに保存しておくだけなら問題ないけどタグの制約も含め取り回しが悪いし
埋め込みcueの利便性の良さもfb2k他再生側の独自機能によるものがほとんどだし
なのでcue自体はプリギャップの保持・確認用と割り切ってトラックごとにロスレス圧縮が安全確実だと思う
あとはmkaとか？作る手間がめんどくさそうで試してないけどどうなんだろうな