>>914-916
動画については、ver3.21で、画質を「旧サーバを使う」にすれば、ver2.40と同じ画質で「サクサク落ちてくる」と思います
多重起動については、NicomentXenoglossia.exe に「-m」とパラメータを付けて実行すると、複数同時に起動できます

コメントの件については、お使いのWindows7で、TLS1.2が優先されていないのが原因かと存じます
（ニコニコ動画の https://nmsg.nicovideo.jp/api/ が、TLS1.2じゃないとダメっぽいです
　「GetFlvには常にhttpを要求する」で、http://nmsg.nicovideo.jp/api/ にアクセスする形になります）

IEでTLS1.2が使われるように設定できれば、「GetFlvには常にhttpを要求する」のチェックを外しても動作すると思います