写真集の切り抜きみたいに画像の一枚一枚で一つのエロになってるような用途の場合は
そら、フォルダをマージしたり、写真を気に入らないのを削除したりとか平気なんだろうけど、
たとえば、ウェブサイトまとめてダウンロードしてきて、
フォルダまるごとが全部で一つのエロを構成している場合（たとえばエロ小説の一章とか）
どこかのファイルと重複してるからってうかつに削除したら話がつながらなくなるから、
そういう場合は削除よりはハードリンクにしてくれると、ディスク容量節約できて、かつ話もつながるから
重複の対処はあとからゆっくりやれる。

俺の場合、環境移行とか環境マージの時とかにそういうフォルダがごそっと出来たりして、
データはとりあえず取っときたいけど、ハードディスクが足りなくなったりするから
ハードリンクは重宝してる。