RAMディスク、管理者権限とかは、
一旦あなたのデスクトップで検証すれば問題を切り分けられるのでは?
その環境ではリムーバブルディスクのINIの書き換えもできないだろうな。
たとえばINIをあなたのデスクトップに一旦持ってきて書き換え、
もどせばできるかもね。
ところでRAMディスクである必要がないな〜。ブラウザみたいにキャッシュ
を展開するわけじゃないし。

英語版?日本語化してないの?

起動時のウィンドウ位置は決められず。
(エクスプローラなどからファイルドラッグ中に、MPlayerのタスクボタン上に
持ってくるとMPlayerが開く、という使い方もある。ウィンドウ最大化主義
なら便利))

コマンドラインは一応、ショートカットファイルや、
Win+R(ファイル名から指定して実行)からだよね。

試してないけど新しく追加された \tools\MPlayerWWServiceStarter.exe
あたりが管理者権限の対策なんじゃないかな。
サービスを起動させてそれにやってもらうみたいな。