ver3です
スタートメニューを登録するようにしてみた。
config.py にの最後（コマンドを登録する　の後）にインデントそろえて書き込むとよいかんじ
sys.setdefaultencoding('SHIFT_JIS')
dirs = [
u'C:/Documents and Settings/xxxxxx/スタート メニュー',
u'C:/Documents and Settings/All Users/スタート メニュー',
]
for dir in dirs:
for root, dirs, files in os.walk( dir, topdown=False ):
for name in files:
m = re.search('^(.*)\.lnk$', name )
if m:
fname = os.path.join( root, name )
ex = window.command_ShellExecute( None, fname, u"", u"" )
window.launcher.command_list += [ ( m.group(1) , ex ) ]
pythonはじめてなんで、なんか間違ってるかも（特に最初のsetdefaultencodingとか）