ソフトウエアの脆弱性ではなくFTP通信が平文で
ユーザー名・パスワードをサーハーに送信するのが問題なだけ

FFFTPはFTPS/SFTPに対応していない(今後も対応は難しい)ので
これらの暗号化通信に対応したサーバーを使用しているのなら
対応ソフトに乗り換えてねって話

その前にGumblarに感染して気付かないのが問題だが・・・