今はバニラに日本語modだけを入れた状態でしょうか？
日本語modと一緒にMPPっていう非公式パッチを入れればクリア不能になるバグ（通りがかりのダンジョン前で襲いかかってくるおっさんを殺すとメインクエストクリア不能とか）はほぼ回避できます

しかしMPPを入れるとせっかく日本語にした箇所がいくらか英語に戻ってしまいます
これを我慢して遊ぶか、MPPに日本語modから抽出した日本語
をインポートしてもう一回日本語化することができます

http://oblivionclarity.blog21.えふしーつー.com/blog-entry-123.html
詳しくはこのブログの記事などを参考にしてください（えふしーつーはアルファベット表記に戻してコピペしてね）