>>773 SEのCKは扱ったことがないので、LEのCKについてお答えします
その読み込もうとしているmodがDLC(Dawnguard、HearthFires、Dragonborn)をマスター指定していると仮定すると

>skyrim.esmを読み込み終えたあたりで動作を停止
How to get Creation kit to open Dawnguard-HearthFires-Dragonborn ttps://www.nexusmods.com/skyrim/mods/21690/?
上記を参照し、SkyrimEditor.iniの[General]と[Archive]の項目に追記してください

>d3d9.dllファイルをリネームまたは退避する
d3d9.dllはENBのファイルですよね、CK編集のたびに出し入れするのも面倒でしょうから
SKYRIM PC版MOD導入ガイド ttp://skyrim-mod.blog.jp/archives/1017737752.html enblocal.iniの編集ガイド の項目を参照し
enblocal.iniの[GLOBAL]に追記してください
IgnoreCreationKit=false

更新したグラボのドライバが原因の可能性もありますので、可能ならアップデート、もしくはロールバックすることもご検討ください