・本体の構成やバージョンにあったMODを用意していますか?
MODは特定の構成に対応して作られているため、他の構成で動かそうとしても正常に動作しません。
BtS日本語化パッチを当てた本体も同様で、それに対応したMODが必要です。
Civ4mod史上後発なパッチですので、現状対応しているMODの数は多くありません。