２５０です。
大本の原因は不明のままですが、問題の解決のご報告とお礼を言いに参りました。

まずアドバイスを頂いた通り、SimPeを使用し、思い出を削除し初期の状態に致しましたが、
問題の解決には至りませんでした。原因は別のところにありました。

問題の二人のシムは、何故か卒業後も学生寮に住んで（正確には、引っ越して）いたのです。
カタログにも居たので迂闊にも見落としておりました。
どうやら、違うロットに同じシムが存在することになるのでおかしな症状を起こしていたようです。

なので、一度学生寮からカタログに移したあと、
SimPeで学生側の家族データを消すことで、引越し時に姿を現さない、ということはなくなりました。
公共区画にも移動できるので、もう再発することはない…のではないかと思います。

余談ではありますが、最初に誤って消してしまったシムは、下手に消したり復活させたりすると、
近所画面がおかしくなるか、他のシムを巻き込んで区画から消えてしまうので、家族一覧から消すだけに留めました。
（自分の知識不足だとは思いますが…）

それでは、長々とお手を煩わせてしまい、お詫びとともに、
解決のために尽力して下さった方々に厚くお礼申し上げます。
ありがとうございました。