【IT】スパコン「富岳」、わずか10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別 [田杉山脈★]

1田杉山脈 ★2020/07/06(月) 21:50:34.92ID:CAP_USER
理化学研究所(理研)は、スーパーコンピュータ「富岳」を活用し、新型コロナウイルス感染症の治療薬の候補となりうる数十種類の物質を発見したと発表した。7月3日、オンラインで開催した「新型コロナウイルスの治療薬候補同定」の中間報告のなかで、理化学研究所 科技ハブ産連本部医科学イノベーションハブ推進プログム副プログラムディレクターであり、京都大学大学院医学研究科教授の奥野恭史氏が明らかにした。

 奥野教授は、「1つの標的タンパク質に対するすべての薬剤での評価が終了し、興味深い結果が出た。残り3つの標的タンパク質においても同様の評価をしたい」とする一方、「数千規模の化合物とタンパク質の作用(結合)過程を、分子動力学計算レベルで計算した事例は世界でもはじめてであり、学術的にインパクトがある」と発言。

 さらに、「今回の結合シミュレーションには約10日間を要したが、ソフトウェアのチューニングが富岳用にできていないかたちで実施したものである。チューニングができれば、将来的には2日程度で計算が完了すると考えている。1週間あれば、1万以上の薬剤が評価できるようになり、創薬の世界を大きく変えることができる」と述べた。
以下ソース
https://pc.watch.impress.co.jp/docs/news/1263445.html

2名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 21:51:21.38ID:AfB/3SGH
謎の女子高生の正体は? 45年前に撮影されたモノクロ写真がカッコよすぎる
http://www.show-beauty.myddns.com/10360.html

3名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 21:51:23.11ID:cpKvbWaA
俺にも使わせてくれ
ソシャゲが快適にプレイできるか試したい

4名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 21:55:07.61ID:/0qWIPOR
さすがARMの高性能CPUはすごいな

5名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 21:59:35.00ID:Z2K7oqhZ
多けりゃいいってモンか?

6名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:00:31.25ID:nFc+VITg
今は分子動力学計算でそんなことまで解るようになったんだな

7名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:03:02.54ID:1AH0K0iO
ちなみに、富岳の最寄り駅は「京コンピュータ前駅」だぜ
京はもう無いけど、駅名を変えるにはスゲー金かかるから、当分このままらしい

8名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:03:12.11ID:7IYd1u14
>>3
意外と出来ないと思うぞ

9名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:04:54.71ID:jORb0OlU
分子動力学計算はgrapeの方が計算速いはずだけど、ARMベースのほうがプログラム構築が汎用的で使いやすいのかな。

10名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:05:03.51ID:Q5OMRiJV
登山漫画の最高峰

11名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:05:39.98ID:sDW1jynz
>>5
レンポーさんご苦労さん
2位じゃダメみたいですね

12名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:06:37.45ID:1g63xeLY
富嶽もARM系だってな!

13名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:07:21.15ID:3RXWDITC
馬鹿パヨ早速歯軋りw

14名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:07:30.90ID:SB6CTMjf
おれが死ぬ確率と死ぬXデーの予測してくれ

15名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:08:04.15ID:xWGlDrgE
富嶽で使われるARMは、AmazonのAWSにも使われているよ。

16名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:08:50.12ID:svClXDTx
でも明日の天気すら当たらないんだろ。
アホみたいに被害も出てるし何の役にも立たない。

17名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:09:09.59ID:t7vAEC5j
臨床試験もバーチャルでできないの?

18名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:09:14.35ID:IAsaYLDT
新薬ができるのは早くて2,3年だろうね。
順調に行けば5年ってとこ
それまでは代用品でだな

19名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:09:18.75ID:4gbHHukk
税金で飯食ってる世界中の二重国籍者の分析をお願いいたします

20名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:09:20.11ID:1E8UAD1S
で、実際の医療現場で薬使えるようになるのはいつなんだい?

21名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:09:31.78ID:ktPFsPJ+
x=rnd(0)

22名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:10:16.79ID:FCdKzH+l
>>10
中島の新型超重爆撃機だぞ


朝鮮人w

23名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:10:29.96ID:QbtQfM3H
これも結局一年もするとアメリカに簡単に抜かれるだろう
GPGPUだとこの半分の予算で倍の性能になる

24名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:10:30.40ID:EnnTwFM9
2000種類って多過ぎね?

25名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:11:34.21ID:bS9f5ADD
>>1
富岳って対コロナ用に前倒しで実戦配備されたんだよな
ガンダムみたいだな ガンガレ!

26名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:12:54.37ID:/qi0ZBX3
これで新型コロナを作ればいいわけか

27名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:13:25.25ID:dbhLOVRn
 


2000も出せば何個かあたって当たり前。


 

28名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:13:31.54ID:v377R+CF
ガスター10で、乗り切るから余裕

29名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:14:22.26ID:sb3G0B34
くそきな臭すぎてレンホー応援したくなるレベル

30名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:14:39.23ID:hzuHVl89
ハゲ治療薬がやっと完成する?

31名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:14:44.29ID:in4rXIyi
いや1種類を選別するならまだしも2000種ってどでもいいだろ

32名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:15:01.64ID:5WqN0ntI
>>25
富岳「待たせたな」

33名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:16:30.13ID:bS9f5ADD
>>32
京が1年掛かる計算を数日でできるらしいからな
21年始動を1年近く前倒ししたとか浪漫すぎる

34名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:17:40.20ID:EnnTwFM9
1種類でも年単位で試験するのに2000種類も試験してたら
いつ出来るのやら。

2位のスパコンで良いんじゃね?

35名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:19:44.82ID:9i/mAyrD
公務員大量解雇時代到来消費税なくなるぞ

36名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:20:44.12ID:zwj0mO+G
>>5
もうちょっと絞って欲しいよな

37名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:23:10.99ID:Uz/qnD6W
>>36
絞ってるぞ
トップ10くらい以外はゴミみたいな効果しかなさそーって
グラフがあったしそれミロ

38名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:24:21.46ID:TwvxQ4Q8
凄えな富嶽。この調子であと一カ月もすれば、
どんな薬でもコロナに効くことが判明するのでは?

39名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:24:31.55ID:H0cRu6Fy
ウンコを入れればウンコが出てくる
それがデータサイエンス

そんな方法で今までどんだけ失敗してきたか
スパコンになっても手法が糞なら糞しか出ないね

40名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:25:01.23ID:deOhSO6b
別に富岳じゃないとできないわけじゃないんじゃないの?

41名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:25:32.34ID:4mMaDjNE
>>3
富岳の計算能力は大体スマホ3000万台分

42名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:28:22.80ID:Uz/qnD6W
>>40
i7のCPU一個でも可能だが何万年もかかるというわけ

43名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:29:02.34ID:wR2xIpx9
自慢にはならない

44名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:30:02.54ID:F6x0oXEo
仮想化して分散処理させた計算とどう違うの?

45名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:30:19.53ID:ncbxTIVS
他国のスパコンだってその位やってるだろう

ぶっちぎりの1位でもないのに

46名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:31:55.84ID:3QG/wvVV
>>1
俺なら2000どころか、もっと挙げてみせるぜ
10倍くらいいけるな

47名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:32:28.55ID:4mMaDjNE
>>45
今はぶっちぎりの一位
そして4種類のベンチマーク全てでの一位(4冠)は史上初

48名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:32:31.28ID:N8Jd+OdJ
富岳チューニングするための丁度良いデータ取りになるからこいつじゃないと意味ないだろうし
ガンガン使って使い勝手上げてほしいものだね

49名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:34:48.21ID:JRgHFmVx
>>5
判定対象が数千種類あって、それを10日で処理したんだろ
なるべく多くを短時間で処理できた方がよかろうよ

50名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:36:01.50ID:JRgHFmVx
>>46
そこから可能性ありと抽出されたのは数十種

51名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:36:02.11ID:85CYw3+B
>>14
ワイコンピュータの計算によると2120年7月1日の時点で生存確率0.001%や

52名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:38:08.80ID:Q8pvCw/X
スパコンより量子コンピューター使ったほうが良くないの?

53名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:39:17.79ID:wR2xIpx9
量子なんかまだない

54名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:42:12.05ID:iQIrvROd
どえらい投資をしてるんだから
 「ワクチンの100や200位」見つけ出すだろう 
   一日も早く先んじて元を取り返すんだな!

55名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:42:37.41ID:KqiHOmUJ
>>9
grapeは専用命令を追加したプロセッサだったような。ただ並列度はわからん。
以前にEDAベンダーのセミナーで発表があった。いわゆる「当社のツールを使ってプロセッサを開発しました」っていう内容で。
もっとも、スパコンとなると並列度が全然違うからな。

56名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:43:29.97ID:yeCZbljY
ちゃんと動いてるかテストしてみた、て感じだな

57名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:44:09.78ID:yUugRfTE
>>5
そこから似た成分で分類とかしていけばもっと減らせるだろ。
もっと考えろ。

58名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:45:03.42ID:JRgHFmVx
>>52
2千台(以上)のワークステーションで処理した方が速いはあるかも

59名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:47:06.23ID:zYQHt2iS
選ぶのではなく、あたらしくコロナにあった薬をつくる事は出来ないの?

60名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:48:25.38ID:EiX4yLv4
トミタケすげえな

61名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:49:56.77ID:Rc/uT9E1
所詮はまだ机上の理論状態

62名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:50:37.68ID:GCuajlqT
またジャップのオナニーかよ

63名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:50:52.72ID:O2MKxlNA
俺もすごい連立方程式考える仕事したいレス

64名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:51:24.01ID:wR2xIpx9
円周率やるよりマシかw

65名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:52:24.02ID:r9+aynDz
2000ってふざけて居るのか、
2個とは言わないが、せめて20個に絞り込めよ

66名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:52:46.99ID:sEJIdoJM
とみ…がく…?

67名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:54:42.40ID:axE3cj3/
>>57
減らした物を提示してくれよ。
贅沢を言うなら、1番効くのはこれだ!と教えて欲しいがw

68名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:56:53.08ID:TDHWv5YM
逆にもっと凄いウィルス作れる?

69名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:57:20.40ID:OmpjzYeZ
あくまでシュミレーション上の結果だから良さそうなシャブを実際に使っても全然クソってのもありうる
全部治験してからの話でしかない
そんなんしてる間に変異するから厄介だしな

70名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 22:59:13.79ID:IOGq2IuB
>>1
俺なら何億種類でも候補に出来るぞ、スパコン超えたな。

71名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:00:07.52ID:z2XuF2+g
ホンダF1制覇の日々
充実してたなあ
JAXAのはやぶさ2と富岳とで
戻ってくりゅ?

72名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:01:11.34ID:dJ6VwwbK
でも、アビガンの承認は当分ありません。

日本は、スパコンや全自動PCR検査機が作れても、活かせない。

73名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:04:22.83ID:kkRSdIun
富岳10台くらいすぐ作れ

74名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:05:23.04ID:h8nKQGyE
しかしスパコンの性能が凄くなっても世の中良くならないもんだな。

75名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:06:03.73ID:LrlB6C3o
>>1
なんだ、スパコンのくせに10日もかかって候補だけかw

76名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:08:11.32ID:xBFF/Y6s
>>14
早よ成仏せーよ
南無南無

77名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:10:21.18ID:2BoBkesL
マイケル冨丘山すごいやん。

78名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:11:24.90ID:A2091wxe
富岳スゴイ

79名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:11:36.66ID:ogllZW85
>>1
富岳の開発費用は1100億円だろう?、
きっと2000億円くらいで売れるよ

80名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:12:06.43ID:dzTQGxiy
>>1
でも、選別結果の実証は、人体実験でやるンですね。 おきらく、ごきらく〜。

81名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:12:37.77ID:uk+io0c6
>>7
あの辺は製薬会社の研究所がいっぱいあったね

82名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:14:38.85ID:8tR2gviP
>>1
2000の中にはサトウの水虫薬とか大正製薬のリアップも入ってるのかな?

83名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:14:45.78ID:FxLU7vxT
2000種類って選別されとらんやんけw

84名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:17:49.52ID:wR2xIpx9
リケンのわかめ

85名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:18:08.15ID:PTPoUQMz
2000は多いな
ここからどうやって効果がありそうなやつを絞っていくんだ?

86名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:18:53.03ID:MR51hR02
フロンティオがやばいな
富岳より先にAIを活用して既存の薬からコロナに効果ある薬を選別する事業始めてたのに
明日暴落不可避

87名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:20:25.94ID:MR51hR02
>>40
別に富岳でなくてもできる
上場企業がすでに同じことしてるし
ただ処理能力高いから他よりもはやくできる

88名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:21:49.90ID:jdYw5baS
本当に良かった 民主系が内閣じゃなくて

89名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:23:07.31ID:1pJpeCP3
陰キャから嫌われるのは確かだがこういうのは実際には陽キャ特有の潤沢な行動回数使って片手間でも色んな作品見てイベントとか行って「オタク」ってアイデンティティーにすがるしかないそこいらの無気力陰キャよりはオタクやれてるんだよなぁ

90名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:26:15.23ID:NZV2j8Pk
 今日本にある承認済みの薬剤を、標的のタンパク化合物にどう作用するかのシミュレーションできるソフトが、とっくの昔に完成していたのが驚き。

91名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:30:22.33ID:1E8UAD1S
いま臨床試験とかやってる薬の効果確認に先に使えよって思うけど

92名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:30:51.95ID:8O+5xJVB
よくわからんけど
シミュレーションソフト作る人もすごくない?

93名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:36:55.65ID:5HK9CnXr
富士通χだな

94名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:38:50.09ID:V2m8qVTn
>>24
富岳たんが使うわけじゃないから、適当かと。

95名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:40:20.58ID:9TtGAbOd
絵に描いた餅か。

やはり無駄遣いだな。

96名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:42:49.38ID:TdVMFCAM
暫くはコロナ薬開発専用機として使った方が世の中の為になるだろうからそれで行って欲しいな。

97名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:44:47.42ID:0nDwEj8L
すげーーーーーーーーーな



日本

98名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:46:56.90ID:DdWgoafx
イベルメクチンだろ
さっさと発表しろ

99名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:52:55.57ID:WZvDqMnF
韓中米はすでに量子コンピュータ競争なのに日本はいつも周回遅れだね。

100名刺は切らしておりまして2020/07/06(月) 23:52:57.79ID:RUn8iuSY
その中から選別するのが大変なのにw

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