CWは戦争起きず、各陣営間で演習やろうぜ！っていえば集まってくれる位友好。かつセイレーンの侵略もアプリ版程もなくキューブも人類に渡ってないので運用も出来ない。そのため指揮官は不要。ゲーム中でもプレイヤーのことを確か指揮官とはよばないはず。
しかしてアプリの方は戦争勃発、セイレーンは攻めてくるは重桜と鉄血は同盟抜けるはでめちゃくちゃ。そんな中キューブに適応出来て運用出来るのが指揮官。CWとちがって駒を生成して制御する、関係を深めていって覚醒を促す等の役割があるから必要。