すいません。
聞くとこが分からないのでここで書きますが、Novaランチャーのホーム画面にChromeのサイトのショートカットを作るのは何か設定がありますか？
Chromeの右上のメニューから『ホーム画面に追加』として『ホーム画面に追加されました』と出ても追加されていません。
これが出来なければだいふ不便です。