今まで本体側に保存されていた本のデータがSDの初期化きっかけで消えたという事では？
充電するだけで消える人もいるみたいだし

内部化していたSDを解除するのはそれなりにリスクのある作業だし
サイズの大きなアプリをインストールする以外は内部化して使うメリットはほとんど無い