そうだったなすまん
端末はXiaomi POCO F1
ROMはオフィシャルのAOSP Extended6.1
20190107-1731のもので、Android pie
Magiskは先述したように18.1の安定版
Magisk Managerは7.0.0

症状としては、気付いたらMagiskがインストールされていないことになっていて、左側のスワイプメニューに表示されるはずの「モジュール」や「ダウンロード」類の項目がいくつか消えている(項目は2つほど残っていた気もするが、どれが残っていたかは忘れてしまった...)。
発症している状態でも、端末の動作が重くなったりバッテリードレインは起こっていない。ログも参照してみたが、エラーは残っていなかった。

唯一気になる点としては、ROMのインストール時からcts pofileがfalseになっていること。しかしbasicintegrityがtrueなことからROMとの相性と判断している。これは当時、何度か焼き直したが直らなかった。