何かペン関係の機能をオフってもだめかな?
XperiaZUltraが鉛筆でもタッチペンになるという特殊なタッチパネルを装備した代わりに音ゲーで同時フリックどころか同時タップが片方無効になる症状があったのでもしかしたら、と。
knoxを使うアプリ(adhell2とか)で完全に無効化してみたらどうですかね?