Fire端末の更新ってこんな感じで結構複雑。

・FireOSの自動更新（おそらくKindle アプリとかのアマゾン標準アプリもこれで自動更新）
・アマゾンアプリストア（アプリ）の自動更新（手動に変えられる）

GP入れた場合は
・GPの自動更新（手動に変えられる）

自分は、GPで入れたアプリがアマゾンアプリストアで自動更新されて不具合出たら嫌だからその自動更新も切ってる。実際それが有り得るのかはわからないが。