それはGooglePlay外(野良)のお話になるからまたちょっと違うかね
基本自動更新にして、頻繁にバグ仕込まれるアプリだけチェック外しとくのが一番手間かからんと思うよ
手動一括更新時もSkip出来るからQuickPic旧版使ってる場合なんかもコレで運用できる